В составе университета находятся 9 факультетов: агрономический, архитектурный, ветеринарной медицины, землеустроительный, компьютерных систем и профессионального обучения, технический, технологический, энергетический, экономический.

Агрономический факультет
Кафедра почвоведения и агрохимии
Кафедра экологии и лесного хозяйства
Кафедра растениеводства

Архитектурный факультет
Кафедра архитектуры
Кафедра дизайна

Факультет ветеринарной медицины
Кафедра ветеринарной медицины
Кафедра ветеринарной микробиологии и биотехнологии
Кафедра ветеринарной санитарии и сертификации продуктов животноводства

Землеустроительный факультет
Кафедра геодезии
Кафедра земельного кадастра
Кафедра землеустройства
Кафедра управления земельными ресурсами

Факультет компьютерных систем и профессионального образования
Кафедра высшей математики
Кафедра информационных технологий
Кафедра компьютерных систем
Кафедра профессионального образования
Кафедра физики и химии

Технический факультет
Кафедра машиностроения
Кафедра механизации технологических процессов
Кафедра сельскохозяйственных и зерноперерабатывающих машин
Кафедра стандартизации, метрологии и сертификации
Кафедра технического сервиса
Кафедра технической механики

Технологический факультет
Кафедра морфологии и физиологии с/х животных
Кафедра охотоведения и рыбохозяйства
Кафедра технологии производства и переработки продуктов животноводства

Экономический факультет
Кафедра бухгалтерского учета и аудита
Кафедра маркетинга и коммерции
Кафедра менеджмента
Кафедра финансов и кредита
Кафедра экономики
Кафедра экономико-математического моделирования
Кафедра экономической теории

Энергетический факультет
Кафедра автоматической электросвязи
Кафедра тепловых электрических станций
Кафедра эксплуатации электрооборудования
Кафедра электроснабжения

Отдел гуманитарных кафедр
Кафедра истории Казахстана
Кафедра казахского языка
Кафедра мировых языков
Кафедра философии