Казахский агротехнический университет им. С. Сейфуллина в результате участия в конкурсах научных исследований по бюджетным программам на 2008 г. заключил договор с МСХ РК:
— по программе 042 «Прикладные научные исследования в области АПК» на сумму 60 020 910 тг. по 26 проектам;
— по системе конкурсных грантов «Повышение конкурентоспособности сельскохозяйственной продукции» на сумму 28 670 000 тг. по 6 проектам.

По МОН РК университет заключил договор:
— по программе 002 «Фундаментальные и прикладные научные исследования» подпрограмма 100 «Фундаментальные научные исследования» научно-технической программа «Биологические основы создания наукоемких технологий для здравоохранения, сельского хозяйства и охраны окружающей среды» на сумму 18031,58 тг. по 4 проектам;
— договор с РГП на ПВХ «НЦБ РК» Комитета науки МОН РК по программе «Разработка современных технологий для формирования кластера по биотехнологии в Республике Казахстан на 2006-2008 годы» на сумму 9 500 000 тг. по 3 проектам.

На сегодняшний день университет имеет финансирование по бюджетным программам 116 222 490 тенге.

В 2008 г. учеными университета были поданы заявки на участие в научных конкурсах:
— по программе 046 «Нормативно — методическое обеспечение развития отраслей агропромышленного комплекса» по 6 лотам;
— инновационные проекты с участием АО «КазАгроинновация» 12 проектов;
— по проведению проектно-аналитических работ совместно с РГП «Центр по исследованию финансовых нарушений» по 1 лоту;
— Комитет науки МО и Н РК по определению высших учебных заведений, при которых могут открываться лаборатории инженерного профиля.

В МСХ РК для формирования новой бюджетной программы на 2009-2011 годы по прикладным научным исследованиям в области агропромышленного комплекса, с учетом современных мировых тенденций и состояния развития отечественного сельского хозяйства по определенным приоритетам для дальнейшего развития аграрной науки:
1) Биотопливо и сопутствующая биопродукция;
2) Производство, переработка и хранение сельхозпродукции;
3) Экологически чистая продукция;
4) Охрана окружающей среды и воспроизводство природных ресурсов;
ученые университета внесли более 50 предложений по тематикам исследований, с актуальностью и востребованностью производством.

По законченным научным достижениям группа ученых университета получили патент за номером 57 получен, на селекционное достижение (порода животных) под названием: «Новый тип казахского черно-пестрого скота «Приишимский» авторами которого являются: Алимжанов Бекен Окенович, Алимжанова Людмила Васильевна, Абдраимов Мырзагельды Торегельдиевич, Беккожин Аманжол Жуанышевич, Григорьев Борис Николаевич, Бостанова Сауле Куанышпековна, Сагинбаев Азамат Куандыкович, Стрелец Александр Владимирович, Жангуразов Ибрагим Даутович, Сауэр Иван Адамович.
Патент зарегистрирован в Государственном реестре (породы животных) Республики Казахстан 12.07.2007 года.

18 января 2008 года Совет молодых ученых университета объявил конкурс на лучшую научно-техническую продукцию, среди молодых ученых университета в возрасте до 35 лет. На конкурс принимались все научно-технические продукции, изданные за последние два года 2005-2007гг.

Заседание конкурсной комиссии по подведению итогов состоялось 7 февраля 2008г. На конкурс поступило 15 работ, рассмотрев все работы и определив баллы, конкурсная комиссия приняло решение:

1. Выдать дипломы и денежные вознаграждение следующим молодым ученым:
Диплом первой степени и денежное вознаграждение в размере 30000 тенге – Куйбагарову Марату Амангельдыевичу — к.в.н., старший научный сотрудник научно-инновационного центра биотехнологии КазАТУ им.С.Сейфуллина
Диплом второй степени и денежное вознаграждение в размере 25000 тенге – Балджи Юрии Александровичу — ассистент кафедры ветеринарной санитарии и сертификации продуктов животноводства» факультета ветеринарной медицины;
Диплом третьей степени и денежное вознаграждение в размере 20000 тенге – Хасанову Вадиму Тагировичу — к.б.н., ст.преподаватель кафедры «Селекции растений и биотехнологии» агрономического факультета;

2. Благодарственные письма и поощрительные денежные вознаграждение по 10000 тенге:
— Бегеновой Айнагуль Байболсыновне — к.в.н., доцент кафедры «Ветеринарной санитарии и сертификации продуктов животноводства» факультета ветеринарной медицины;
— Костюченковой Оксане Николаевне — ст.преподаватель кафедры «Технический сервис» технического факультета.